Ποινική δίωξη άσκησε η εισαγγελία Πρωτοδικών της Αθήνας στον πατέρα Αντώνιο και την πρεσβυτέρα Σταματία Γεωργαντή, για τα κακουργήματα της απιστίας, της υπεξαίρεσης και της νομιμοποίησης παράνομου χρήματος.
Οι κατηγορίες τους απαγγέλθηκαν μετά την ολοκλήρωση της πολύμηνης έρευνας που διενεργούσε ο εισαγγελέας Πρωτοδικών Ιωάννης Σέβης για τα οικονομικά της Κιβωτού του Κόσμου. Η δικογραφία ανατέθηκε σε ανακριτή, ο οποίος στη συνέχεια θα καλέσει τον ιερέα και την πρεσβυτέρα να απολογηθούν.
Σύμφωνα με την δίωξη η πρεσβυτέρα φέρεται να έχει τελέσει τα αδικήματα της απιστίας και της υπεξαίρεσης ως φυσικός αυτουργός ενώ στον κληρικό σύζυγό της αποδίδεται ηθική αυτουργία στις παραπάνω πράξεις. Και οι δύο βαρύνονται με πράξεις που αφορούν ξέπλυμα χρημάτων.
Εξ άλλου, ποινική δίωξη ασκήθηκε και σε δύο ακόμη πρόσωπα. Πρόκειται για έναν πρώην εργαζόμενο στη ΜΚΟ και ένα συγγενικό πρόσωπο των βασικών κατηγορουμένων, οι οποίοι διώκονται για συνέργειας σε πλημμεληματική υπεξαίρεση. Ο πρώην υπάλληλος φέρεται να «γύρισε» 30.000 ευρώ από τον μισθό του στην Κιβωτό, ενώ σε θυρίδα του συγγενή που κατοικεί σε νησί του Αιγαίου, εντοπίστηκαν 57.000 ευρώ, σύμφωνα με την ΕΡΤ.
Σύμφωνα με πληροφορίες, το αδίκημα της απιστίας συνίσταται σε αναιτιολόγητες δαπάνες άνω των 190.000 ευρώ, ποσά που σχετίζονται με την αγορά από το ζεύγος ακινήτου στην Πωγωνιανή και τις επισκευές που έγιναν σε αυτό. Επίσης, αφορά σε εκταμιεύσεις 2 εκατ. ευρώ από τα ταμεία της Κιβωτού του Κόσμου για τα οποία δεν υπάρχουν παραστατικά. Κατά τις εισαγγελικές αρχές, τα χρήματα αυτά εκταμιεύτηκαν για άλλους σκοπούς από αυτούς που υπηρετεί η οργάνωση.
Η υπεξαίρεση, επίσης, σε βαθμό κακουργήματος, αφορά τα χρήματα και τιμαλφή ύψους περίπου 470.000 ευρώ που βρέθηκαν στο διαμέρισμα της οργάνωσης που χρησιμοποιούσε ο πατέρας Αντώνιος, καθώς και τα χρήματα, τα κοσμήματα και τις χρυσές λίρες που εντοπίστηκαν σε θυρίδες αλλά και 300.000 ευρώ που λείπουν από τα διαθέσιμα της Οργάνωσης.